На вътрешния половите органи вена се намира в седалищния (хълбока) регион.
Той се намира между сакроспинозния лигамент и сакротуберкуларния лигамент в дупето, а отзад до (зад) ишиалния гръбначен стълб, който представлява област от кост, която стърчи от долната част на таза.
Вътрешната пудендална вена лежи успоредно с вътрешната пудендална артерия, която носи кислородна кръв в същия регион. Пудендалният нерв също лежи покрай тези два кръвоносни съда и инервира същия регион. Вътрешната пудендална вена, вътрешната пудендална артерия и пудендалният нерв са свързани заедно с дебел лист тъкан, наречен обтуратор интернус фасция. Тази групирана група се нарича пудендален канал.
Вътрешната пудендална вена източва кръв, изтощена от кислород от перинеума, която е зоната между външните полови органи и ануса и външните гениталии. Изцедената област включва луковицата на пениса (при мъжете) или клитора (при жените), аналната област и урогениталната област.
Притоците на вътрешната пудендална вена включват вената на луковицата (при мъжете), задната лабиална вена (при жените), скроталната вена (при мъжете) и долната ректална вена. Вътрешната пудендална вена се оттича във вътрешната илиачна вена. Въпреки местоположението си, дълбоката дорзална вена, която източва еректилните тела на пениса (при мъжете), не преминава във вътрешната пудендална вена.
